In Fachzeitschriften wurde der spektakuläre Museumsbau schon vor der Eröffnung hoch gelobt. Nun hat das Museum weitere Auszeichnungen erhalten: Der Red Dot Design Award ist ein internationaler Wettbewerb, dessen Auszeichnung, der Red Dot, als Qualitätssiegel für gutes Design in Fachkreisen hoch geschätzt wird. Mit fast 6000 Anmeldungen aus insgesamt 52 Ländern zählt er zu den größten Designwettbewerben weltweit. Die Auszeichnung wird an Arbeiten verliehen, die sich durch herausragende Designqualität auszeichnen. Das Mercedes-Benz Museum erhielt den Red Dot Design Award für die Internetseite " www.mercedes-benz.com/museum" und für das Ausstellungskonzept.
Beim XXII. Festival Automobile International erhielt das Mercedes-Benz Museum den "Grand Prix de L'Architecture". In der Begründung der Jury heißt es: "Die Architekten haben es in weniger als drei Jahren Bauzeit geschafft, der Stadt Stuttgart ein neues Stadttor zu errichten. Das Bauwerk mit seinen beiden Spiralen, die einer DNA-Struktur nachempfunden sind, beherbergt die gesamte über 120-jährige Geschichte der Automobilität - und somit die Geschichte der Marke Mercedes-Benz." Außerdem ist das Museum unter den sieben Finalisten des "Mies van der Rohe Preises 2007". Dieser von der EU vergebene Preis gilt als eine der wichtigsten Auszeichnungen für zeitgenössische Architektur. Der Sieger wird Mitte April bekannt gegeben.